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CMA技术在先天性多发性畸形临床诊断中的应用研究

杨晓

原陆军总医院附属八一儿童医院

目的: 运用染色体核型分析对100例先天性多发畸形新生儿进行初步的遗传学病因分析,再采用染色体微阵列分析(chromosomal microarray analysis, CMA)技术对染色体核型分析未能明确病因的病例,进行基因组拷贝数变异(copy number variants, CNVs)检测,探讨CMA技术辅助染色体核型分析的诊断价值,为这类患儿的临床诊断、治疗和遗传咨询提供帮助。探讨染色体微阵列分析技术(CMA)在先天性多发畸形新生儿遗传病因学诊断中的应用价值。
方法: 对100新生儿的外周血进行染色体核型分析方法,抽取静脉血 3 ml,肝素钠抗凝,接种于人外周血染色体培养基(青岛莱佛生物)中,放入37℃ 恒温箱中培养72 h,常规方法收获细胞,制备中期染色体标本;将标本在胰酶溶液中消化16秒,姬姆萨染液染色38分钟,在显微镜(油镜)下进行染色体G-显带核型分析。每个受检者计数 30个细胞,分析 5个核型;对嵌合体和有异常核型者计数 100个细胞,分析 10个核型,结果按人类细胞遗传学国际命名体制 ( ISCN 2009) 的标准命名。对未发现染色体异常的新生儿,则采用CMA的方法检测基因组CNVs,CMA染色体微阵列分析的具体方法过程,包括DNA的准备、DNA消化、引物连接、PCR、纯化、片段化、标记、杂交、洗染及扫描。提取患儿EDTA抗凝血2-4 ml,用Tiangen公司的TIANamp Blood血液基因组DNA提取试剂盒提取全血基因组DNA,采用美国Affymetrix®公司的Cytescan®HD Array Kit and Reagent Kit Bundle试剂盒制备样本DNA并加入CytoScan750K芯片,在美国Affymetrix®公司的CytoScanTM Assay 8平台上进行洗染和扫描,应用Affymetrix® Chromosome Analysis Suite (ChAS)芯片分析软件进行数据分析,得出CNVs。利用国际数据库分析CNVs的致病性。
结果: 100例患儿的临床表现以心血管系统畸形合并其他系统畸形最为多见,占69%;G-显带核型分析显示21例患儿存在染色体异常,染色体异常检出率21%,其中,常染色体数目异常9例,性染色体数目异常2例,常染色体结构异常10例;染色体核型正常的79例患儿经CMA分析基因拷贝数变异(CNVs)后,发现7例患儿存在CNVs,4例为致病性CNVs,2例为未见明确致病性报道CNVs,1例为临床意义不明CNV。
 
结论:  CMA技术具有分辨率高、覆盖度广的优势,可以从亚微观结构发现缺失和重复,对先天性多发性畸形新生儿进行遗传病因学诊断,从而为疾病的遗传咨询和干预治疗提供重要依据。